Vologda terletak di tepi kanan sungai dengan nama yang sama, yang merupakan jalur air kuno yang menghubungkan kota ini melalui lembah sungai Sukhona dan Sheksna dengan Arkhangelsk.
Untuk pertama kalinya dalam sumber-sumber sejarah kota itu disebutkan pada abad XII. Pada abad ke-15, Vologda diperintah oleh Veliky Novgorod. Dari 1462 selama dua puluh tahun Vologda adalah pusat kerajaan appanage, tetapi dari 1481 itu jatuh di bawah kekuasaan kerajaan Moskow, yang penguasa saat itu adalah Ivan III.
Pada 1565 Ivan the Terrible memutuskan untuk mendirikan kediaman oprichnina keduanya di Vologda. Dia ingin membangun batu Kremlin dan benteng di sini. Ribuan pengrajin dan petani digiring ke Vologda, dan pembangunannya dipimpin oleh insinyur Inggris H. Locke. Dalam rencana, Kremlin berbentuk persegi panjang. Di sisi utara, itu dilindungi oleh Sungai Vologda, dan di kedua sisi parit dengan air digali. Tetapi serangan Khan Krimea pada tahun 1571 dan wabah yang dimulai di Vologda memaksa Ivan IV untuk kembali ke Moskow. Dengan kepergian raja, konstruksi dihentikan.
Karena tidak adanya benteng yang serius, Vologda sangat menderita akibat invasi tentara Polandia-Lithuania pada tahun 1612. Tetapi kota itu dengan cepat dibangun kembali dan bahkan melebihi ukuran aslinya. Pada akhir abad ke-17, pusat sejarah Vologda terdiri dari empat bagian: Kota, Verkhniy Posad, Nizhniy Posad, dan Zarechye. Namun, pada awal abad ke-18, posisi ekonomi Vologda agak melemah karena berdirinya Sankt Peterburg dan berkembangnya perdagangan di Laut Baltik.
Pada 1708 Vologda dimasukkan ke wilayah Arkhangelsk. Tetapi sudah pada 1719 kota itu menjadi pusat provinsi Vologda, dan pada 1796 - pusat provinsi Vologda, yang ada hingga 1929.
Pada abad ke-19, kota ini menjadi tempat pengasingan politik bagi banyak anggota intelektual. Pada tahun 1918, Vologda memainkan peran "ibu kota diplomatik" Rusia selama 5 bulan. Setelah berakhirnya Perjanjian Perdamaian Brest, kedutaan besar dan misi dari 11 negara besar sementara pindah ke sini, khususnya: AS, Inggris Raya, Prancis, Jepang, Cina, Brasil, dll.
Sekarang Vologda adalah pusat wisata populer yang dikunjungi oleh orang Rusia dan turis asing.
